图书介绍

生物大分子的数学描述及其应用【2025|PDF|Epub|mobi|kindle电子书版本百度云盘下载】

生物大分子的数学描述及其应用
  • 李春，钱伟懿著 著
  • 出版社： 大连：大连理工大学出版社
  • ISBN：9787561146446
  • 出版时间：2009
  • 标注页数：172页
  • 文件大小：5MB
  • 文件页数：181页
  • 主题词：生物高分子－研究

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图书目录

第0章 绪论1

0.1 生物信息学产生的背景1

0.2 生物信息学的研究对象4

0.2.1 核酸5

0.2.2 蛋白质7

0.2.3 中心法则和遗传密码8

0.3 生物信息学的主要研究内容11

0.3.1 序列比较11

0.3.2 计算机辅助基因识别14

0.3.3 系统发育分析17

0.3.4 RNA和蛋白质的结构研究18

0.4 本书的主要内容19

参考文献21

第1章 生物大分子的图形表示33

1.1 引言33

1.1.1 DNA序列的图形表示34

1.1.2 RNA二级结构的图形表示40

1.1.3 蛋白质序列的图形表示42

1.2 DNA序列的3-D图形表示45

1.3 DNA序列的2-D图形表49

1.3.1 特征序列49

1.3.2 基于特征序列的“双水平线”图51

1.3.3 基于特征序列的“梯状”图53

1.4 有向图表示57

参考文献58

第2章 生物序列的数值刻画65

2.1 引言65

2.2 伪迹68

2.3 ALE-指标75

2.3.1 ALE-指标75

2.3.2 性质77

2.3.3 应用81

2.4 上三角矩阵表示87

2.4.1 序列不变量的相容性87

2.4.2 有向图及上三角矩阵的应用89

2.5 正规化相对熵93

2.5.1 定义94

2.5.2 应用96

参考文献100

第3章 序列与结构的粗粒化描述105

3.1 DNA序列的逻辑表示106

3.1.1 逻辑表示同其他表示的比较108

3.1.2 逻辑序列的S/S矩阵及其压缩矩阵111

3.2 蛋白质序列的逻辑表115

3.2.1 蛋白质序列的逻辑表示116

3.2.2 应用119

3.3 基于5-字母模型的蛋白质序列的图形表示及应用122

3.3.1 氨基酸的5-字母模型123

3.3.2 蛋白质序列的2-D图形表示124

3.3.3 蛋白质序列的数值刻画125

3.3.4 冠状病毒的系统发育分析128

3.4 LZ复杂度及应用131

3.4.1 有限序列的LZ复杂度131

3.4.2 基于LZ复杂度的RNA二级结构相似性分析134

3.4.3 广义LZ复杂度及应用137

参考文献143

第4章 蛋白质编码基因识别151

4.1 引言151

4.2 DNA序列基于正规化相对熵的数值刻画154

4.3 Fisher线性判别法155

4.4 算法的评估157

4.4.1 敏感度、特异性和准确度的定义157

4.4.2 算法的评估159

4.5 识别酿酒酵母基因组2-6类中的基因162

参考文献167

结语172

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